所得税はボーナスからも徴収されていますが、市・県民税はどうなるのでしょうか？

サラリーマンの場合は、所得税は通常、給与・賞与などが支払われる際に源泉徴収され、年末調整により税金を精算することとされています。
一方、市・県民税の場合は、前年の所得により税額を計算した特別徴収税額通知書を市から勤務先（特別徴収義務者）に通知し、それに基づいて勤務先（特別徴収義務者）が毎月の給与の支払の際に税金を徴収する、特別徴収という制度を採用しています。
そのため、所得税は給与と賞与から徴収されていますが、市・県民税は給与からのみの徴収となっています。